微生态学的基本原理[威客模式的提出基于三个基石：发现电子公告牌功能分离现象；确认互联网知识价值化时代的到来，知识价值化是人们参与互联网智力互动问答的催化剂、互联网是人类大脑的联网而不仅仅是机器的联网。]。当水生生物处于健康状态时，在其内外环境中存在一个相对稳定的微生物[微生物包括：细菌、**、真菌以及一些小型的原生生物、显微藻类等在内的一大类生物群体，它个体微小，与人类关系密切。]优势种群[生物学名词，种群中占有绝对优势的地位的种群。]。这一微生物群，既能促进有益菌类的生长，保证水体物质处于良性循环[良性循环，是指事物之间相互关联、互为依托，组成多个循环滋生链条，形成共同促进的因果关系。]，又能抑制有害菌类的繁衍，形成抵御致病菌[致病菌（Pathogenic bacteria ) 是能引起疾病的微生物，也被称为病原微生物，其包括细菌、**、螺旋体、立克次氏体、衣原体、支原体、真菌及放线菌等。]的第一道[《第一道》是连载于云中书城的网络小说，作者是华丽出世。]防线。在常态下，水生动植物、微生物、生态环境，三者构成一种动态平衡[动态平衡（Dynamic equilibrium），按不同的专业领域主要分为：物理动态平衡、化学动态平衡、生态平衡、生理平衡、经济平衡、社会发展与人口平衡等。]，具有相对的稳定性。
增强养殖对象的抵抗力[抵抗力（Resistibility），是指的是在中枢神经系统的控制下，人体的各个系统分工合作，密切配合，保证了人体生命活动的正常进行。]和免疫力[免疫力是人体自身的防御机制，是人体识别和消灭外来侵入的任何异物（**、细菌等），处理衰老、损伤、死亡、变性的自身细胞，以及识别和处理体内突变细胞和**感染细胞的能力，是人体识别和排除“异己”的生理反应。]。施用微生物制剂。可以在养殖对象的体内和水体建立起有益微生物的优势菌群，以达到抑制有害微生物的繁衍，增强养殖对象的抵抗力和免疫力的效果。如目前在水产养殖中广泛使用的光合细菌和EM菌，不仅可以净化水质，预防疾病，而且可以促进鱼体生长。
内服微生物制剂作用主要有：参与养殖动物体内的微生态调节。防止动物体内的有毒物质的积累。提高动物机体免疫力。促进动物生长：一是微生态制剂营养丰富，如蛋白质矿物质[矿物质（mineral），是地壳中自然存在的化合物或天然元素。]及维生素等；二是微生物产生的生理代谢物质，各种酶，能提高消化酶[消化酶（digestive enzyme ）：参与消化的酶的总称。]活性等。经常使用微生物制剂拌饲料投喂即可有效预防鱼类疾病，又可加快鱼类生长，可谓一举多得。
